毒力因子抗体谱研究

     基于PhIP-seq技术平台，太阳娱乐集团app下载建立了毒力因子抗原库。毒力因子蛋白数据库主要来自VFDB（The virulence factor database），除此之外，还包括IEDB（Immune Epitope Database）中人类蛋白、过敏原蛋白、病毒蛋白之外的蛋白表位，主要以寄生虫和细菌蛋白为主。该抗原库涵盖>1300种细菌、寄生虫等的>12000种毒力因子蛋白，共计17.3万条肽段。

毒力因子抗原库(AbCode_Toxin Lib)信息。A. 该抗原库涵盖广泛的毒力因子蛋白，主要来源为VFDB和IEDB数据库；B. 按所包含的蛋白数量排序，Top20的物种信息；C. 每个蛋白的多肽设计规则，即每个蛋白切割为多条50%重叠、长度为56 aa的肽段并展示于噬菌体表面。

应用案例

                                                    健康人群的细菌抗体谱                                                  

Vogl等利用肠道微生物和毒力因子噬菌体肽库，构建了健康人群的抗体谱，评估了其表位多样性和稳定性，

并初步建立了免疫力解码的模型（2021，Nature Medicine）。

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参考文献

[1] Vogl T, Klompus S, Leviatan S, Kalka IN, Weinberger A, Wijmenga C, Fu J, Zhernakova A, Weersma RK, Segal E. Population-wide diversity and stability of serum antibody epitope repertoires against human microbiota. Nat Med. 2021 Aug;27(8):1442-1450.