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技术平台
AbMap抗体表位解析平台PhIP-Seq平台蛋白质/多肽芯片平台邻近标记技术平台-SPIDER

Technical Introduction

AbMapTM,高通量抗体识别表位解析技术,让你对你的抗体多了解一点。

 抗体识别表位(Epitope)是抗体的核心表征,是抗体评估的重要维度,是抗体功能的关键要素。AbMapTM高通量抗体识别表位解析技术,联合通用的噬菌体展示肽库、高通量测序和AI算法,可快速、准确、低成本、高通量地鉴定抗体的识别表位,并提供核心氨基酸信息。

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  依托技术团队多年的持续性研究与整理,太阳娱乐集团app下载建立起了具有高度覆盖性和预测准确性的抗体表位解析数据库 — AbData数据库。该数据库涵盖近万个抗体信息。

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对于输入的某一特定抗体,数据库会显示其完整的注释信息(Antigen_name, Uniprot-ID, Gene_ID, Immunogen_seq等),通过AbMap表位解析技术获得的短肽结合谱(Binding peptide profile)以及(可能存在的)共有基序(Motif),共有基序可准确提炼关键氨基酸以及抗体识别序列的偏好性,用于解析表位。

   以三个科学界重点关注的抗体为例,下面展示了AbData数据库中对这些抗体的表位解析和预测情况。

Human IL-6

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     Human IL-13

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     HIV-1 Reverse Transcriptase图片4.png

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如上所示,AbData数据库展现的分析和预测结果,无论是准确性还是广泛性上都非常出色。


基于高通量测序和AI算法,可快速、准确、低成本、高通量的鉴定抗体的短肽结合谱以及结合表位,并提供核心氨基酸信息。同时,数据库中存储的大量信息对于制备高质量的抗体亦有重要的价值。



欢迎您的进一步了解!


Technical Principles

   基于一个通用的、高多样性的、12aa长度的噬菌体随机肽库,AbMap可快速检测抗体所识别的肽段,并通过算法获得其氨基酸序列的模式(Pattern)或共有基序(Motif)。通过一级序列比对或三维构象重构可获得其识别表位。同时,共有基序可准确提炼关键氨基酸以及抗体识别序列的偏好性。NGS可实现多种抗体的并行检测分析。


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Technical advantages

分辨率高

准确度高

通量高,成本低

样本损耗少

分辨率高
准确度高
通量高,成本低
样本损耗少

Application Cases

       针对某个针对SARS-CoV-2刺突的抗体,通过AbMap首先获得其识别的氨基酸基序,并通过序列比对获得了其线性表位(红色标注序列),同时提示其中的K, P, Q, Q为核心氨基酸。为了验证该结果,合成了数条带有氨基酸单点突变的多肽,并构建了多肽芯片进行该抗体检测,结果和预期一致,关键氨基酸突变极大削弱抗体的结合,其它氨基酸突变则影响较小。

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Applicable sample types

单抗,多抗; 全长IgG,Fab;人源,鼠源,兔源等。

Sample requirements

抗体浓度:>0.5 mg/mL; 纯度:>85%; 总量:>1 μg