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膜蛋白受体鉴定

受体鉴定是生命科学研究中的重要问题。与可溶性蛋白质之间的蛋白质-生物分子相互作用相比,涉及受体-配体等膜蛋白的蛋白质-生物分子相互作用的研究更具挑战性,因为传统蛋白质鉴定方法中,维持蛋白质构象和活性较为困难。

      太阳娱乐集团app下载在细胞表面配体的识别上,可提供两套方案供选择:

方案1:新型邻近标记技术-SPIDER+MS检测

SPIDER技术一种新型的邻近标记技术,可兼容活细胞,直接捕获细胞表面、处于天然状态的靶标蛋白,在受体鉴定领域具有显著的技术优势。

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SPIDER技术原理


应用案例:

为了测试SPIDER识别细胞表面配体的能力,太阳娱乐集团首先检验了SARS-CoV-2 S1蛋白与其已知受体ACE2之间的相互作用,SPIDER反应直接在培养皿中进行(如下图A),太阳娱乐集团观察到SPIDER反应前后细胞死亡率无变化。通过显示ACE2-SAm-PupE的迁移变化确认了SARS-CoV-2 S1与ACE2之间的结合(如下图B)。

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SPIDER技术用于筛选和发现SARS-CoV-2 Omicron RBD新受体


与传统Pulldown+MS相比,SPIDER+MS具有显著的优势:1) 适用于膜蛋白鉴定,可支持活细胞-诱饵分子结合和检测;2)通用性强,诱饵分子可为蛋白质、抗体、DNA/RNA、小分子等多种类型;3)可检测弱相互作用。此外,SPIDER+MS比其它邻近标记技术亦有诸多优势,详见下表:

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原文链接:Specific pupylation as IDEntity reporter (SPIDER) for the identification of protein-biomolecule interactions



方案2:HuProtTM芯片—人全蛋白质组高度覆盖全长蛋白质芯片

      HuProtTM人类全蛋白质芯片固定了>21,000种人重组蛋白,其中~90%为全长蛋白。该芯片天然是一种高质量的蛋白质自身抗原库,能够精确定位于靶点蛋白结合的小分子,并且可以实现特定环境下难以捕捉的靶标鉴定。

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应用案例

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JCI-芯片在乳腺癌研究上的进展(Wang et al.,2018)

       HuProtTM人类全蛋白质芯片固定了>21,000种人重组蛋白,其中~90%为全长蛋白。该芯片天然是一种高质量的蛋白质自身抗原库,能够实现更全面和灵敏的评估。

原文链接:JCI - HIC1 deletion promotes breast cancer progression by activating tumor cell/fibroblast crosstalk